Optimizacija
tehnik magnetno resonančnega slikanja za napoved uspeha trombolize (2018-2021)
Financiranje: ARRS – Javna agencija za raziskovalno
dejavnost RS
Šifra: J3-9288
Vodja: prof.
dr. Igor Serša, Institut Jožef
Stefan
Trajanje:
1.7.2018―30.6.2021
Letni obseg
financiranja: 1142 ur razreda D
Veda:
Medicina
Sodelujoče
RO: - Institut Jožef Stefan
- Medicinska fakulteta, Univerza v Ljubljani
- Univerzitetni klinični center Ljubljana
Vsebinski opis projekta:
V projektu smo proučevali možganske krvne strdke pri pacientih z
akutno ishemično možgansko kapjo in sicer smo si zadali za cilj najti
povezave med parametri, ki jih dobimo pri slikanju možganskih krvnih strdkov s
parametri poteka interventnega zdravljenja in tudi s končnim izidom
zdravljenja ter najti ustrezno metodo slikanja, ki te parametre optimalno
prikaže. Znano je namreč, da je pri ishemični možganski kapi
ključna čim prejšnja rekanalizacija s
strdkom zaprte žile, pri čemer uporabljamo trombolitično
in/ali mehansko odstranjevanje krvenega strdka. V
obeh primerih je uspeh močno povezan z mikroskopsko zgradbo strdka,
deležem eritrocitov in trombocitov in z njimi povezano gostoto fibrinske mreže.
Slednja je namreč odgovorna za porozno strukturo krvnega strdka in s tem
tudi na njegov prepustnost za dostop trombolitičnega
sredstva kakor tudi za mehansko trdnost strdka in s tem povezano težavnostjo
njegove mehanske odstranitve. Natančna ocena zgradbe in sestave strdkov je
torej pomembna tudi pri načrtovanju zdravljenja in prognozi uspeha rekanalizacije.
V projektu smo uspeli pokazati, da nam tako standardno CT slikanje kot tudi
naprednejše metode magnetno resonančnega slikanja (T2 in ADC kartiranje)
omogočajo pridobiti parametre relevantne za načrtovanje zdravljenja
in napoved končnega izida zdravljenja. Pri tem je med obema metodama
bistvena razlika ta, da je CT slikanje že sedaj del standardne slikovne diagnostike
pacientov s sumom na možgansko kap v domačih urgentnih centrih, med tem ko
lahko rezultate MR slikanje visoke ločljivosti zaenkrat dobimo le na
možganskih strdkih in vitro, torej strdkih pridobljenih z mehansko trombetomijo. V naših raziskavah smo pokazali, da lahko s
CT slikanjem pri ishemični kapi ne določimo le mesto strdka (zapore)
in njegovo dolžino, ampak tudi izmerimo radio-gostoto strdka v enotah Hounsfielda (HU) (COBISS.SI-ID 79857923). To je podatek, ki
je običajno prezrt, mi pa smo pokazali, da je radio-gostota strdka
pokazatelj pomemben tako za oceno težavnosti rekanalizacije
zaprte žile kot tudi za končni izid zdravljenja kapi. Z obema
uporabljenima metodama MR kartiranja (T2 in ADC) smo pridobili natančnejše
podatke o zgradbi strdka (COBISS.SI-ID 32890919). Ti podatki zopet korelirajo
tako s potekom rekanalizacije žilne zapore, kot tudi
s končnim izidom zdravljenja. Kot najobčutljivejši parameter se je
izkazala variabilnost ADC. V primeru mehanske rekanalizacije
žilne zapore je ta parameter najbolje napovedal njeno težavnost.
Kot rezultat tega projekta smo v laboratoriju za slikanje z magnetno
resonanco razvili/implementirali še dve novi MR slikovni metodi in sicer
slikanje difuzijskega tenzorja (COBISS.SI-ID 108348931) in oceno
električne prevodnosti vzorca na osnovi MR slikanja tokovne gostote s
pomočjo merjenja razpada magnitudnega MR signala
(COBISS.SI-ID 106745859). Obe metodi omogočata pridobivanje novih
kontrastnih parametrov, ki so uporabni za karakterizacijo strdkov.
Sestava projektne
skupine: Povezava na SICRIS
Projektni sklopi in
njihova realizacija:
Osnovna hipoteza tega raziskovalnega projekta je, da pri
slikanju bolnikov s sumom na ishemično možgansko kap lahko dobimo za
diagnostiko več uporabnih parametrov kot se jih sedaj uporablja. To velja
tako za osnovno nativno CT slikanje kot tudi v
primeru naprednejšega multiparametričnega
slikanja z magnetno resonanco, ki se zaenkrat še ne uporablja v naših centrih
urgentne medicine, v tujini pa že. Za obe slikovni mododaliteti
(CT in MRI) smo v projektu to hipotezo tudi potrdili. Projekt smo v fazi
prijave razdelili na 6 raziskovalnih sklopov od katerih se zadnja dva nista
izvajala zaradi polovičnega obsega financiranja. Delo na vsakem od teh
štirih sklopov, zastavljeni cilji in njena realizacija je sledeča:
1.
Pridobivanje
vzorcev možganskih krvnih strdkov (cilj je pridobiti večje
število vzorcev možganskih krvni strdkov za analizo)
V okviru
projekta smo pridobili možganske krvne strdke 30 bolnikov z možgansko kapjo. Ti
so bili pridobljeni s postopkom trombektomije pri
tistih bolnikih pri katerih predhodno trombolitično
zdravljenje ni imelo željenega učinka in se žilna zapora ni sprostila.
Možganski strdki, ki so bili vključeni v analizo, so bili vsi iz
področja srednje možganske arterije (MCA). Za vse pridobljene strdke smo
podrobno spremljali vse pomembne podatke trombektomičnega
posega, to je čas začetka posega s trombektomično
napravo do vzpostavitve toka krvi skozi zaprti segment žile, število potrebnih
prehodov s trombektomično napravo. Za vsakega
bolnika smo imeli zabeležene tudi vse njegove klinične parametre in dostop
do CT slik pacientov in možnostjo njihove naknadne analize. Za študijo smo
pridobili predhodno soglasje etične komisije št. 0120-99/2021/7.
Pridobivanje vzorcev strdkov je potekalo predvsem v prvi polovici projekta, v
nadaljevanje pa je bilo oteženo zaradi prehoda na nov način mehanske rekanalizacije na UKC Lj, ki
temelji na sesalni odstranitvi (sistem Penumbra), pri
kateri se strdek odstrani po fragmentih, tako da njegova slikovna analiza po
odstranitvi ni več možna. Pred tem je bil uporabljan sistem MERCI, kjer so
bili strdki odstranjeni v enem kosu in skoraj »nepoškodovani«.
2.
Optimizacija
metod MR slikanja za T1, T2, ADC in MT mapiranje (cilj je razviti
metode, ki bodo omogočale visokoločljivo
slikanje možganskih krvnih strdkov z magnetno resonanco)
V naslednji fazi
smo vsak pridobljen krvni strdek čim prej po pridobitvi odnesli na IJS,
kjer smo ga MR slikali na 2,35 T sistemu za visokoločljivo
slikanje. Slikanje je vključevalo naslednje metode: 3D T1 obteženo,
kartiranje relacijskega časa T2 in kartiranje navidezne difuzijske
konstante (ADC). Ti rezultati so objavljeni v članku [1]. Poleg tega smo
implementirali/razvili še dve MR slikovni metodi in sicer DTI slikanje [3] in
slikanje električne prevodnosti [4]. Zaradi zmanjšanega/prekinjenega dostopa
do vzorcev krvnih strdkov ti metodi še nista bili uporabljeni za slikanje
možganskih krvnih strdkov.
V primeru DTI
gre sicer za uveljavljeno metodo, ki je poleg v raziskovalni rabi na
kliničnih MR sistemih že vse bolj dostopna tudi kot del naprednejše
komercialne programske opreme. V primeru našega sistema za MR mikroskopijo te
slikovne metode še nismo imeli in je tudi ni bilo možno kupiti, zato smo jo
morali razviti sami. To delo je vključevalo nov pulzni program za zajem
DWI slik pri gradientih v različnih smereh prostora in program za
izračun DTI tenzorja iz DWI slik. Na osnovi diagonalizacije
DTI tenzorja smo lahko nato izračunali vse tri lastne vrednosti in lastne
vektorje, njegovo frakcijsko anizotropijo in srednjo vrednost difuzije. Nadalje
smo razili programe za prikaz difuzijskega tenzorja z difuzijskimi elipsoid in
še posebej smo ponosni na zahteven program, ki lahko iz prostorske slike DTI
tenzorja sledi vlaknom tkiva, kar je v literaturi znani kot difuzijska traktografija. Uspeh naše implementacije DTI metode je tudi
izredna prostorska ločljivost, ki jo metoda ima. Dosegli smo namreč
ločljivost 35 mikrometrov, kar je vsaj en velikostni red bolje od
rezultatov dobljenih na kliničnih MRI sistemih. Ravno ta visoka ločljivost
odpira tudi nova zanimiva področja uporabe na analizi tkiv med katera
nedvomno sodijo tudi krvni strdki. Iz našega dela na razvoju DTI metode je
doslej nastala ena magistrska naloga, še ena magistrska naloga je v pripravi.
Objavili pa smo tudi znanstveni članek iz naših rezultatov uporabe DTI
metode za analizo medialnega živca [3]. Enako metodo bomo uporabili tudi za DTI
slikaje možganskega krvnega strdka, takoj ko nam bo tak vzorec spet dostopen.
Metoda za oceno
električne prevodnosti je bila razvita povsem na novo. Doslej objavljeni
pristopi za oceno prevodnosti iz slik tokovne gostote namreč temeljijo na
pridobivanju slik tokovne gostote iz faze MR signala. V tem delu je bilo
prvič predstavljeno novo spoznanje, namreč da prisotnost
električnega toka v vzorcu povzroči nastanek dodatnega gradienta
magnetnega polja, ki vodi do porušitve homogenosti magnetnega polja v vzorcu in
posledično do hitrejšega razpada MR magnitudnega
signala. Ta metoda je bila zaenkrat preverjena le na testnih vzorcih in bo
potrebno njeno pravo uporabnost za analizo tkiv, med katere spadajo tudi krvni
strdki, šele dokazati. Vendar je gotovo, da gre v tem primeru za povsem nov
kontrastni mehanizem, ki doslej še ni bil pogosto uporabljan. Po večini je
namreč kontrast v MR slikah posledica različnih NMR relaksacijskih
časov tkiv ali različnih difuzijskih lastnosti. Glede na to, da je ta
metoda nova, je bila ugodno sprejeta s strani najpomembnejše revije s
področja slikanja z magnetno resonanco »Magnetic
Resonance in Medicine« in tam tudi objavljena [4].
3.
Histološka
in IHC analiza pridobljenih možganskih krvnih strdkov (cilj histološke
analize je pridobiti natančno informacijo o morfologiji ter sestavi krvnih
strdkov)
Po končani
preiskavi strdka z magnetno resonanco smo tega dali naprej v histološko
analizo. Pri tem smo vsak strdek prerezali v vzdolžni smeri in analizirali
centralno rezino z imuno histološko analizo in sicer z nespecifičnim
barvanjem s hematoksilinom in eozinom (HE), in s
specifičnimi barvanji z monoklonskimi
protitelesi na prisotnost eritrocitov (Anti-Human glikoforin A, GPA) in na prisotnost trombocitov (Anti-Human Integrin
β-3/CD61, CD61). Ti rezultati so objavljeni v člankih [1,2].
4.
Statistična
analiza MR map in IHC slik, načrtovanje napovednih modelov za zdravljenje
kapi (cilj je potrditi obstoj korelacij med MR slikami, IHC
slikami ter parametri trombektomije)
Za vsakega
bolnika smo pridobili poleg kliničnih parametrov in parametrov postopka
mehanske rekanalizacije še tri tipe slik
odstranjenega možganskega strdka in sicer visokoločljive
MR slike, histološke slike (HE, GPA, CD61) ter CT sliko. Vse pridobljene slike
strdkov smo analizirali tako, da smo iz njih pridobili karakteristične
parametre in sicer iz MRI slik smo določili povprečno vrednost T2 in
ADC, variabilnost T2 in ADC, določili smo lahko tudi dolžni odstranjenega
strdka. Iz rentgenskih slik smo določili povprečno rentgensko gostoto
strdka (v enotah Hounsfield, HU). Histološke slike pa
so nam omogočile določitev deleža eritrocitov ter trombocitov v
pridobljenih strdkih. Tako pridobljene parametre različnih vrst slik smo
nato analizirali na prisotnost možnih korelacij med njimi.
V primeru
analize MR slik smo ugotovili, da obstaja negativna korelacija med deležem
eritrocitov in povprečno vrednostjo ADC ter pozitivna korelacija med deležem
eritrocitov in povprečno vrednostjo T2. Pozitivno korelacijo smo pokazali
tudi med dolžino strdka in časom postopka trombektomije
do vzpostavitve pretoka krvi skozi zaprto srednjo možgansko arterijo (rekanalizacijo). Zelo očitna je bila tudi korelacija med
številom prehodov trombektomične naprave in
časom do rekanalizacije. Pokazali smo, da
obstaja očitna razlika med strdki, ki so pri odstranjeni samo z enim
prehodom tormbetomične naprave in tistimi za
katere je bilo potrebnih več prehodov in sicer imajo slednji precej nižjo
povprečno vrednost ADC in precej višjo variabilnost ADC od strdkov
odstranjenih z enim prehodom trombektomične
naprave. Te rezultate smo objavili v članku [1] in v vabljenem predavanju
[5].
V primeru
obdelave CT slik smo pokazali, da je možno iz njih pridobiti tudi podatke o
radio-gostoti (HU), ki so pokazatelj kompaktnosti strdka. Strdki z večjo radiogostoto imajo namreč večjo koncentracijo
eritrocitov in s tem tudi hemoglobina (železa), ki je večji absorbent
rentgenskih žarkov. Ker se gostejši strdki težje topijo v postopku trombolize in se jih zaradi njihove večje kompaktnosti
in torej tudi mehanske trdnosti težje mehansko odstranijo pri postopku trombektomije, obstaja pozitivna korelacija med težavnostjo
rekanalizacije zaprte možganske žile in izmerjeno
radio-gostoto strdka. Pokazali smo tudi, da je bolje kot meriti absolutno
vrednost radio-gostote meriti razliko izmerjene radio-gostote na okludiranem mestu žile (v našem primeru so to bila MCA
mesta) in njenem simetričnem normalnem mestu na drugi polovici možganov.
Te izsledke smo objavili v članku [2].
Bibliografske reference
1. VIDMAR,
Jernej, BAJD, Franci, MILOŠEVIČ, Zoran, KOCIJANČIČ, Igor,
JEROMEL, Miran, SERŠA, Igor. Retrieved cerebral thrombi studied by T2 and
ADC mapping : epreliminary results. Radiology and oncology. [Print ed.]. 2019, vol. 53, no. 4,
str. 427-433, v. ISSN 1318-2099. DOI: 10.2478/raon-2019-0056. [COBISS.SI-ID
32890919]
2. VILTUŽNIK,
Rebeka, VIDMAR, Jernej, FABJAN, Andrej, JEROMEL, Miran, MILOŠEVIČ, Zoran,
KOCIJANČIČ, Igor, SERŠA, Igor. Study of correlations between CT properties of retrieved cerebral
thrombi with treatment outcome of stroke patients. Radiology and oncology.
[Print ed.]. 2021, vol. 55,
no. 4, str. 409-417, graf. prikazi, tabeli. ISSN 1318-2099. DOI: 10.2478/raon-2021-0037.
[COBISS.SI-ID 79857923]
3. AWAIS, Kanza, SNOJ, Žiga, CVETKO, Erika, SERŠA, Igor. Diffusion tensor imaging of a median nerve by magnetic
resonance : a pilot study. Life.
2022, vol. 12, iss. 5, str. 748-1-748-13, ilustr. ISSN 2075-1729. https://www.mdpi.com/2075-1729/12/5/748,
DOI: 10.3390/life12050748. [COBISS.SI-ID 108348931]
4. SERŠA,
Igor. Electric current detection based on the MR signal magnitude decay. Magnetic resonance in medicine. [Online
ed.]. [in press] 2022, 10
str., ilustr. ISSN 1522-2594. DOI: 10.1002/mrm.29278.
[COBISS.SI-ID 106745859]
5. SERŠA,
Igor. Magnetic resonance microscopy
of blood clots. V: 10th Kraków Workshop on Novel Applications of Imaging and
Spectroscopy in Medicine, Biology
and Material Sciences,
23-25 September, 2019 Kraków, Poland. Str. 25-26.
[COBISS.SI-ID 32729639]